Elk product dat fosfonaat bevat, valt onder het toepassingsgebied van Verordening 1107/2009 inzake gewasbeschermingsmiddelen. Een meststof die fosfonaat bevat, wordt beschouwd als niet-conform met de Verordening EG 2003/2003 en het koninklijk besluit van 28/01/2013 inzake meststoffen.
Het gebruik van meststoffen die fosfonaat bevatten kan leiden tot de aanwezigheid van residuen die de maximale residulimieten overschrijden.